Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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