Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Cyp4f39Q8BGU0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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