Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Atg4bQ8BGE6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Atg4bQ8BGE6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Atg4bQ8BGE6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Atg4bQ8BGE6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Atg4bQ8BGE6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Atg4bQ8BGE6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Atg4bQ8BGE6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Atg4bQ8BGE6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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