Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Lrrc1Q80VQ1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Lrrc1Q80VQ1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Lrrc1Q80VQ1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrc1Q80VQ1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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