Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

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Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sgo2Q7TSY8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sgo2Q7TSY8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sgo2Q7TSY8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sgo2Q7TSY8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sgo2Q7TSY8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sgo2Q7TSY8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sgo2Q7TSY8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sgo2Q7TSY8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sgo2Q7TSY8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo2Q7TSY8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo2Q7TSY8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo2Q7TSY8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo2Q7TSY8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgo2Q7TSY8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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