Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2bQ7TPM1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms