Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms