Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Uhrf2Q7TMI3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Uhrf2Q7TMI3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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