Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sys1Q78S06 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms