Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trak1Q6PD31 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms