Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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