Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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