Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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