Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms