Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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