Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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SspnQ62147 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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SspnQ62147 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SspnQ62147 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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