Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms