Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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