Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BcanQ61361 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BcanQ61361 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BcanQ61361 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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BcanQ61361 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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