Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms