Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms