Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Atf3Q60765 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Atf3Q60765 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms