Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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