Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms