Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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