Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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