Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms