Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Gm28047Q3US59 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Gm28047Q3US59 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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