Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx27Q3UHD6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx27Q3UHD6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms