Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm5742-201ENSMUST00000120764 505 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Rnf219-204ENSMUST00000228448 1056 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Tnip3-208ENSMUST00000212402 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf166Q3U9F6 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms