Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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