Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otud5Q3U2S4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otud5Q3U2S4 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms