Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms