Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rufy4Q3TYX8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms