Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms