Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms