Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms