Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms