Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MestQ07646 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms