Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AmbpQ07456 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms