Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms