Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Thbs2Q03350 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Thbs2Q03350 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Thbs2Q03350 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Thbs2Q03350 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Thbs2Q03350 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Thbs2Q03350 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Thbs2Q03350 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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