Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300.4 ms