Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GscQ02591 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms