Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms