Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms