Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms