Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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