Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smn1P97801 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smn1P97801 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms