Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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